Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SPIDRQ14159 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SPIDRQ14159 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SPIDRQ14159 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SPIDRQ14159 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SPIDRQ14159 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SPIDRQ14159 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SPIDRQ14159 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SPIDRQ14159 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SPIDRQ14159 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SPIDRQ14159 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SPIDRQ14159 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPIDRQ14159 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms