Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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COL9A3Q14050 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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COL9A3Q14050 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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COL9A3Q14050 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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COL9A3Q14050 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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COL9A3Q14050 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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COL9A3Q14050 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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COL9A3Q14050 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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COL9A3Q14050 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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COL9A3Q14050 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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COL9A3Q14050 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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COL9A3Q14050 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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COL9A3Q14050 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL9A3Q14050 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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