Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms