Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATRQ13535 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATRQ13535 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ATRQ13535 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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