Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATMQ13315 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATMQ13315 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATMQ13315 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATMQ13315 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATMQ13315 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATMQ13315 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATMQ13315 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATMQ13315 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATMQ13315 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATMQ13315 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATMQ13315 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATMQ13315 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATMQ13315 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATMQ13315 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATMQ13315 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATMQ13315 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATMQ13315 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATMQ13315 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATMQ13315 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATMQ13315 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATMQ13315 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ATMQ13315 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATMQ13315 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATMQ13315 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ATMQ13315 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
ATMQ13315 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ATMQ13315 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ATMQ13315 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ATMQ13315 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ATMQ13315 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ATMQ13315 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.17
ATMQ13315 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.17
ATMQ13315 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ATMQ13315 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ATMQ13315 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATMQ13315 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATMQ13315 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATMQ13315 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATMQ13315 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATMQ13315 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATMQ13315 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATMQ13315 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATMQ13315 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATMQ13315 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATMQ13315 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATMQ13315 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATMQ13315 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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