Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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