Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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SEMA3BQ13214 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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