Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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CBX3Q13185 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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CBX3Q13185 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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CBX3Q13185 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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CBX3Q13185 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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CBX3Q13185 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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CBX3Q13185 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
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