Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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