Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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