Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXD4Q12950 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144 ms