Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.17
CENPEQ02224 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CENPEQ02224 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms