Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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