Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATP9BO43861 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms