Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LRRTM2O43300 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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