Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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USP17L12C9JPN9 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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USP17L12C9JPN9 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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USP17L12C9JPN9 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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USP17L12C9JPN9 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP17L12C9JPN9 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP17L12C9JPN9 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP17L12C9JPN9 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP17L12C9JPN9 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP17L12C9JPN9 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP17L12C9JPN9 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP17L12C9JPN9 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP17L12C9JPN9 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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