Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms