Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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LHX9Q9NQ69 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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LHX9Q9NQ69 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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LHX9Q9NQ69 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LHX9Q9NQ69 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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LHX9Q9NQ69 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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LHX9Q9NQ69 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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