Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms