Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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FOXQ1Q9C009 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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