Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRIQ1Q96JM4 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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LRRIQ1Q96JM4 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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LRRIQ1Q96JM4 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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LRRIQ1Q96JM4 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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LRRIQ1Q96JM4 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRIQ1Q96JM4 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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