Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD1Q8NHV4 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD1Q8NHV4 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD1Q8NHV4 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD1Q8NHV4 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD1Q8NHV4 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD1Q8NHV4 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD1Q8NHV4 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD1Q8NHV4 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD1Q8NHV4 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD1Q8NHV4 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD1Q8NHV4 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD1Q8NHV4 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD1Q8NHV4 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD1Q8NHV4 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD1Q8NHV4 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD1Q8NHV4 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD1Q8NHV4 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms