Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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CHCHD4Q8N4Q1 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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