Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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USP53Q70EK8 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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USP53Q70EK8 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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USP53Q70EK8 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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USP53Q70EK8 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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USP53Q70EK8 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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USP53Q70EK8 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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USP53Q70EK8 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP53Q70EK8 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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