Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
COL24A1Q17RW2 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms