Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTL8BQ17RB0 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.9 ms