Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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ECM1Q16610 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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ECM1Q16610 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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ECM1Q16610 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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ECM1Q16610 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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ECM1Q16610 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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ECM1Q16610 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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ECM1Q16610 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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ECM1Q16610 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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ECM1Q16610 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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ECM1Q16610 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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ECM1Q16610 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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ECM1Q16610 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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ECM1Q16610 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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ECM1Q16610 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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ECM1Q16610 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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