Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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