Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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RPE65Q16518 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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RPE65Q16518 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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RPE65Q16518 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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RPE65Q16518 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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RPE65Q16518 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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RPE65Q16518 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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