Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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