Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
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SEC23BQ15437 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SEC23BQ15437 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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SEC23BQ15437 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SEC23BQ15437 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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