Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERPUD1Q15011 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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