Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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