Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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COL9A2Q14055 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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COL9A2Q14055 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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COL9A2Q14055 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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COL9A2Q14055 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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COL9A2Q14055 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
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COL9A2Q14055 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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