Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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DDX39BQ13838 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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DDX39BQ13838 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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DDX39BQ13838 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDX39BQ13838 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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DDX39BQ13838 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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DDX39BQ13838 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
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DDX39BQ13838 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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DDX39BQ13838 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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DDX39BQ13838 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
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DDX39BQ13838 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDX39BQ13838 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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