Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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NCOA4Q13772 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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NCOA4Q13772 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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