Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
ALCAMQ13740 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms