Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NME3Q13232 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
NME3Q13232 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
NME3Q13232 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
NME3Q13232 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms