Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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NR1H3Q13133 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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NR1H3Q13133 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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NR1H3Q13133 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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