Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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IFT88Q13099 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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IFT88Q13099 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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IFT88Q13099 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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IFT88Q13099 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
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IFT88Q13099 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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