Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDC16Q13042 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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