Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PRDM2Q13029 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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