Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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