Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROQ12816 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROQ12816 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROQ12816 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROQ12816 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROQ12816 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROQ12816 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROQ12816 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROQ12816 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROQ12816 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROQ12816 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROQ12816 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TROQ12816 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TROQ12816 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROQ12816 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROQ12816 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROQ12816 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TROQ12816 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TROQ12816 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TROQ12816 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TROQ12816 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TROQ12816 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TROQ12816 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TROQ12816 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TROQ12816 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TROQ12816 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TROQ12816 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TROQ12816 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TROQ12816 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TROQ12816 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TROQ12816 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TROQ12816 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TROQ12816 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TROQ12816 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TROQ12816 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TROQ12816 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TROQ12816 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TROQ12816 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TROQ12816 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TROQ12816 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TROQ12816 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TROQ12816 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TROQ12816 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TROQ12816 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TROQ12816 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TROQ12816 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TROQ12816 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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