Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
E2F1Q01094 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms