Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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