Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRMP28827 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRMP28827 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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PTPRMP28827 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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PTPRMP28827 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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PTPRMP28827 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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PTPRMP28827 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRMP28827 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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PTPRMP28827 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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PTPRMP28827 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRMP28827 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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