Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRBP23467 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms