Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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