Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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RFXAPO00287 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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RFXAPO00287 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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RFXAPO00287 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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RFXAPO00287 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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RFXAPO00287 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFXAPO00287 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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